Şehir hayatı bağırsak bakterilerimizi nasıl değiştiriyor?

Kiel Üniversitesi ve Massachusetts Teknoloji Enstitüsü uzmanları, insan bağırsağında yaşayan bakterilerin genetik özelliklerinin içinde bulundukları yaşam koşullarıyla bağlantılı olduğunu ortaya koydu. Sanayileşmiş ve gelişmiş toplumlarda yaşayan mikroorganizmaların daha geniş bir gen setine sahip olduğu, bu ek genetik materyalin önemli bölümünün diğer mikroplardan geldiği belirlendi.

Gen kazanımının başlıca mekanizmalarından birinin, bakterilerin çoğalmaya gerek kalmadan kalıtsal materyal alışverişi yapmasını sağlayan yatay DNA aktarımı olduğu görüldü. Tespit edilen gen kazanımı vakalarının yüzde 80 ila 90'ının bu yolla gerçekleştiği belirlendi. Bakterileri enfekte eden plazmitler ve virüsler de aktarımda rol aldı.

Biyoinformatik uzmanı Lenard Santo'nun uyarladığı evrimsel analiz yöntemleri, söz konusu değişimlerin görece yakın dönemde ortaya çıktığını gösterdi.

Farklı ülkelerden binlerce genom incelendi

Araştırmada, dokuz ülkede yaşayan 56 kişiden elde edilen 5981 bakteriyel genomdan oluşan bir koleksiyon kullanıldı. Koleksiyona, mikroorganizma kültürlerinden izole edilen 1841 yeni genom eklendi.

Bu materyal, Global Microbiome Conservancy uluslararası girişimi kapsamında Kamerun, Gana, Malezya, Nijerya ve Ruanda'dan 20 gönüllü tarafından sağlandı.

On bağırsak bakterisi türünün karşılaştırılması, endüstriyel yaşam tarzına sahip insanların vücudunda yaşayan suşların protein üretiminden sorumlu ortalama olarak daha fazla gene sahip olduğunu gösterdi. Sekiz türde belirlenen farklılıklar istatistiksel açıdan anlamlı bulundu.